Программа Конгресса омиксных технологий

Полногеномное, полноэкзомное и таргетное секвенирование, секвенирование длинными ридами, ДНК микрочипы

Модераторы: Скрябин Н. А. (Томский НИМЦ), Киров И. В. (ВНИИСБ, МФТИ)

Рыжкова О. П. (Москва)
(МГНЦ им. Н. П. Бочкова)
тема доклада уточняется

Степанов В. А. (Томск)
(Томский НИМЦ)
Популяционная геномика для медицинской генетики

Хитринская И. Ю. (Томск)
(Томский НИМЦ)
Омиксные портреты выживания: адаптивная эволюция коренного населения Сибири и Дальнего Востока

Костарева А. А. (Санкт-Петербург)
(НМИЦ им. В. А. Алмазова)
тема доклада уточняется

Киров И. В. (Москва)
(ВНИИСБ, МФТИ)
тема доклада уточняется

---

Бисульфитное секвенирование, ChIP-секвенирование, ATAC-секвенирование, модификации гистонов, Hi-C анализ, метилочипы

Модераторы: Лебедев И. Н. (Томский НИМЦ), Фишман В. С. (ИЦиГ)

Фишман В. С. (Новосибирск)
(ИЦиГ СО РАН)
Расшифровка механизмов развития наследственных заболеваний, связанных с нарушением трёхмерной укладки генома

Васильев С. А. (Томск)
(НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ)
Эпигеномное и транскриптомное профилирование плаценты при невынашивании беременности

Глотов А. С. (Санкт-Петербург)
(НИИ акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д. О. Отта)
Перспективы эпигеномных исследований в пренатальной диагностике

Беспалов Н. А. (Санкт-Петербург)
(НИИ акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д. О. Отта)
Малые некодирующие РНК в фолликулярной жидкости и культуральной среде: сравнительный анализ и взаимосвязь с морфологией доимплантационных эмбрионов человека

---

Bulk РНК-секвенирование, эпитранскриптомика, функциональная геномика, РНК-микрочипы

Модераторы: Трифонова Е. А. (Томский НИМЦ), Скоблов М. Ю. (МГНЦ)

Трифонова Е. А. (Томск)
(Томский НИМЦ)
Транскриптомные исследования как инструмент персонализированной медицины (20 мин)

Кель А. (Dublin)
(GeneXplain GmbH, Wolfenbuettel, Germany; Royal College of Surgeons in Ireland, Ireland)
Идентификация мастер регуляторов на основе транскриптомного анализа как подход к поиску новых терапевтических средств при болезни Крона (онлайн) (20 мин)

Вяхирева Ю. В. (Москва)
(МГНЦ)
Алгоритмические подходы для интерпретации транскриптомных данных ONT (15 мин)

Ткаченко А. А. (Санкт-Петербург)
(НИИ Отта)
Мета-анализ транскриптомных исследований гестационного сахарного диабета (15 мин)

Бабовская А. А. (Томск)
(Томский НИМЦ)
Популяционная транскриптомика человека в норме и при патологии (15 мин)

Федотова Я. А. (Москва)
(МГНЦ)
Ингибирование NMD в РНК-анализe для интерпретации генетических вариантов (15 мин)

Доклад из тезисов (10 мин)

Доклад спонсора (10 мин)

---

MALDI-TOF масс-спектрометрия, жидкостная хроматография с тандемной масс-спектрометрией, криоэлектронная микроскопия, рентгеноструктурный анализ, ЯМР-спектроскопия

Модератор: Пономаренко Е. А. д.б.н., чл.-корр. РАН, и.о. директора, Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В. Н. Ореховича (ИБМХ), Москва

Горшков М. В. (Москва)
к.ф.-м.н., к.т.н., руководитель обособленного структурного подразделения
ИНЭПХФ им. В. Л. Тальрозе ФИЦ ХФ РАН
DirectMS1: полнопротеомный анализ без MS/MS для максимизации пептидного покрытия и выявления новых молекулярных механизмов патологий в экспресс-протеомике

Никольский К. С. (Москва)
мл. научный сотрудник лаборатории структурной протеомики
Научный центр практического образования ИБМХ
Инструменты структурной протеомики: от базы данных структурных мотивов белков до de novo секвенирования пептидов

Кононихин А. С. (Москва)
к.ф.-м.н., старший научный сотрудник
Центр био- и медицинских технологий, Сколтех
Развитие методов количественной протеомики крови для диагностики заболеваний

Нарыжный С. Н. (Гатчина)
д.б.н., заведующий лабораторией протеомики
НИЦ «Курчатовский институт» – ПИЯФ им. Б. П. Константинова
Протеомные подходы в поиске онкологических маркеров

Новикова С. Е. (Москва)
к.б.н., научный сотрудник лаборатории системной биологии,
Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В. Н. Ореховича (ИБМХ)
Протеомный подход для определения молекулярных механизмов индуцированной ретиноевой кислотой гранулоцитарной дифференцировки

---

Газовая хроматография и масс-спектрометрия, жидкостная хроматография с масс-спектрометрией, ЯМР-спектроскопия, непосредственная масс-спектрометрия (shotgun lipidomics)

Модераторы: Черноносов А. А. (ИХБФМ), Апполонова С. А. (Сеченовский университет)

Лабутин А. В. (Томск)
(ОГБУЗ «Томский Областной наркологический диспансер»)

Рогачёв А. Д. (Новосибирск)
(Новосибирский институт органической химии им. Н. Н. Ворожцова)

Черноносов А. А. (Новосибирск)
(ИХБФМ СО РАН)

Яншоле В. В. (Новосибирск)
(Международный томографический центр СО РАН)

---

scDNA-seq, scMethyl-seq, scATAC-seq, scChIP-seq, 3′, 5′ и полнотранскриптное секвенирование

Модераторы: Денисов Е. В. (Томский НИМЦ), Волчков П. Ю. (МФТИ)

Хозяинова А. А. (Томск)
(Томский НИМЦ)
Технологии анализа единичных клеток и пространственная транскриптомика в исследовании опухолевой пластичности

Максимов Д. О. (Долгопрудный)
(МФТИ)
Видоспецифичные адренокортикальные клеточные популяции и механизмы обновления надпочечников

Яневски А. (Санкт-Петербург)
(ЕУСПБ)
Одноклеточное РНК- и ДНК-секвенирование для оценки клональной гетерогенности и эволюции опухолей

Тычинин Д. И. (Москва)
(ЦСП ФМБА)
Транскрипционные и эпигенетические изменения иммунных клеток крови при сахарном диабете 1 типа

Лукьянов Д. К. (Москва)
(ИБХ)
Учёт сплайсинга в scRNA-seq раскрывает транскрипционную гетерогенность субпопуляций CD4 T-клеток

---

Транскриптомика и протеомика: имиджинг in situ и пространственное баркодирование

Модераторы: Ямщиков П. С. (Томский НИМЦ), Гусев О. А. (Центр мозга и нейротехнологий ФМБА)

Валяева А. А. (Москва)
(МГУ)
Пространственный ландшафт стромы колоректального рака: интеграция scRNA-seq и Visium HD

Крупинова Ю. А. (Москва)
(МФТИ, МКНЦ им. А. С. Логинова)
Новый взгляд на происхождение нейроэндокринных опухолей поджелудочной железы

Санковский Р. (Фрайбург)
(University of Freiburg)
Decoding the Leptomeninges in Glioblastoma: Balancing Immune Surveillance and Tumor Progression

Иконников А. В. (Москва)
(РУДН)
Пространственная транскриптомика панникулитоподобной Т-клеточной лимфомы детского возраста

Коробейникова А. В. (Москва)
(ЦСП ФМБА)
Пространственная транскриптомная гетерогенность перстневидноклеточного рака желудка

---

16S рРНК и полногеномное секвенирование, метатранскриптомика, микробиом, виром, мобилом и фунгиом

Модераторы: Шаршов К. А. (ФИЦ ФТМ), Комиссаров А. Б. (НИИ гриппа им. А. А. Смородинцева)

Гончаров А. Е. (Санкт-Петербург)
(Институт экспериментальной медицины)
Микробиомы ископаемых животных Арктической зоны России
Соавторы: Хорошилов В. Ю., Колоджиева В. В.

Мацвай А. Д. (Москва)
(ЦСП ФМБА России)
Изучение разнообразия вирусов в природных резервуарах: метавиром рукокрылых

Шаршов К. А. (Новосибирск)
(НИИ вирусологии ФИЦ ФТМ, НГУ)
Вирусная метагеномика и поиск новых вирусов в клещах

---

Модераторы: Арбатский М. С. (РНИМУ Пирогова), Оконечников К. В. (НМИЦ онкологии им. Н. Н. Блохина)

Vlamos P. (Корфу)
(Ionian University, Bioinformatics and Human Electrophysiology Laboratory)
Quantitative analysis and mathematical modeling of biomarkers to support clinical decision-making and translational research

Wang Y. (Шэньчжэнь)
(BGI Genomics)
тема доклада уточняется

Tian C. (Пекин)
(Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences)
Разработка китайско-российской технологии извлечения знаний в области старения и построение базы знаний

Николаев, Кононихин (Москва)
(Сколтех)
База данных белков крови для мониторинга здоровья методами таргетной хромато-масс-спектрометрии

Аветисян (Москва)
(ИСП РАН)
тема доклада уточняется

Колпаков (Москва)
(Сириус)
BioUML – towards a universal research platform

Зарубин (Томск)
(Томский НИМЦ)
тема доклада уточняется

---

Модераторы: Прохорчук Е. Б. (ФИЦ Биотехнологии), Недолужко А. В. (ЕУСПБ)

Малеев Л. (Москва)
(Сколтех)
Эпигенетические часы для древней ДНК

Жур К. (Москва)
(ФИЦ Биотехнологии)
Геномика строителей мегалитов Кавказа

Манахов А. (Сириус)
(Сириус)
Фанагория

Андреева Т. (Москва)
(ИОГен)
Русские

Pinhassi R. (Вена)
(University of Vienna)
тема доклада уточняется

Недолужко А. (Санкт-Петербург)
(ЕУСПБ)
тема доклада уточняется

---