Программа Конгресса омиксных технологий
Предварительное расписание. Программа дополняется.
Секция 1. Геномика
Полногеномное, полноэкзомное и таргетное секвенирование, секвенирование длинными ридами, ДНК микрочипы
Модераторы: Скрябин Н. А. (Томский НИМЦ), Киров И. В. (ВНИИСБ, МФТИ)
Степанов В. А. (Томск)
д.б.н., профессор, академик РАН, директор Томского НИМЦ
Томский НИМЦ
Популяционная геномика для медицинской генетики
Рыжкова О. П. (Москва)
д.м.н., начальник информационно-аналитического отдела ФГБНУ МГНЦ им. Н. П. Бочкова, в.н.с. ЦКП «Геном» ФГБНУ МГНЦ им. Н. П. Бочкова
МГНЦ им. Н. П. Бочкова
Полногеномное секвенирование: новое в известном
Хитринская И. Ю. (Томск), Колесников Н. А. (Томск), Степанов В. А. (Томск)
Хитринская И. Ю. – к.б.н., заместитель директора Томского НИМЦ
Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Омиксные портреты выживания: адаптивная эволюция коренного населения Сибири и Дальнего Востока
Костарева А. А. (Санкт-Петербург)
д.м.н., профессор, директор Института молекулярной биологии и генетики ФГБУ НМИЦ им. В. А. Алмазова
ФГБУ НМИЦ им. В. А. Алмазова
Геномика врожденных заболеваний миокарда: в поисках золотого сечения
Киров И. В. (Москва / Долгопрудный)
д.б.н., заведующий лабораторией маркерной и геномной селекции растений во ВНИИСБ
ВНИИСБ, МФТИ
тема доклада уточняется
Секция 2. Эпигеномика
Бисульфитное секвенирование, ChIP-секвенирование, ATAC-секвенирование, модификации гистонов, Hi-C анализ, метилочипы
Модераторы: Лебедев И. Н. (Томский НИМЦ), Фишман В. С. (ИЦиГ)
Фишман В. С. (Новосибирск)
ИЦиГ СО РАН
Расшифровка механизмов развития наследственных заболеваний, связанных с нарушением трёхмерной укладки генома
Васильев С. А. (Томск)
НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ
Эпигеномное и транскриптомное профилирование плаценты при невынашивании беременности
Глотов А. С. (Санкт-Петербург)
НИИ АГиР им. Д. О. Отта
Перспективы эпигеномных исследований в пренатальной диагностике
Беспалов Н. А. (Санкт-Петербург)
НИИ АГиР им. Д. О. Отта
Малые некодирующие РНК в фолликулярной жидкости и культуральной среде: сравнительный анализ и взаимосвязь с морфологией доимплантационных эмбрионов человека
Секция 3. Транскриптомика
Bulk РНК-секвенирование, эпитранскриптомика, функциональная геномика, РНК-микрочипы
Модераторы: Трифонова Е. А. (Томский НИМЦ), Скоблов М. Ю. (МГНЦ)
Трифонова Е. А. (Томск)
Томский НИМЦ
Транскриптомные исследования как инструмент персонализированной медицины (20 мин)
Кель А. (Dublin)
GeneXplain GmbH, Wolfenbuettel, Germany; Royal College of Surgeons in Ireland, Ireland
Идентификация мастер регуляторов на основе транскриптомного анализа как подход к поиску новых терапевтических средств при болезни Крона (онлайн) (20 мин)
Вяхирева Ю. В. (Москва)
научный сотрудник
МГНЦ им. Н. П. Бочкова
Алгоритмические подходы для интерпретации транскриптомных данных ONT (15 мин)
Ткаченко А. А. (Санкт-Петербург)
НИИ АГиР им. Д. О. Отта
Мета-анализ транскриптомных исследований гестационного сахарного диабета (15 мин)
Бабовская А. А. (Томск)
Томский НИМЦ
Популяционная транскриптомика человека в норме и при патологии (15 мин)
Федотова Я. А. (Москва)
младший научный сотрудник
Медико-генетический научный центр им. ак. Н. П. Бочкова
Ингибирование NMD в РНК-анализe для интерпретации генетических вариантов (15 мин)
Доклад из тезисов (10 мин)
Доклад спонсора (10 мин)
Секция 4. Протеомика
MALDI-TOF масс-спектрометрия, жидкостная хроматография с тандемной масс-спектрометрией, криоэлектронная микроскопия, рентгеноструктурный анализ, ЯМР-спектроскопия
Модератор: Пономаренко Е. А. д.б.н., чл.-корр. РАН, и.о. директора, Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В. Н. Ореховича (ИБМХ), Москва
Горшков М. В. (Москва)
к.ф.-м.н., к.т.н., руководитель обособленного структурного подразделения
ИНЭПХФ им. В. Л. Тальрозе ФИЦ ХФ РАН
DirectMS1: полнопротеомный анализ без MS/MS для максимизации пептидного покрытия и выявления новых молекулярных механизмов патологий в экспресс-протеомике
Никольский К. С. (Москва)
м.н.с. лаборатории структурной протеомики
ИБМХ им. В. Н. Ореховича
Инструменты структурной протеомики: от базы данных структурных мотивов белков до de novo секвенирования пептидов
Кононихин А. С. (Москва)
к.ф.-м.н., старший научный сотрудник лаборатории клинической протеомики
НМИЦ акушерства, гинекологии и перинатологии им. ак. В. И. Кулакова; Сколтех
Развитие методов количественной протеомики крови для диагностики заболеваний
Нарыжный С. Н. (Гатчина)
д.б.н., заведующий лабораторией протеомики
НИЦ «Курчатовский институт» – ПИЯФ им. Б. П. Константинова
Протеомные подходы в поиске онкологических маркеров
Новикова С. Е. (Москва)
к.б.н., научный сотрудник лаборатории системной биологии
ИБМХ им. В. Н. Ореховича
Протеомный подход для определения молекулярных механизмов индуцированной ретиноевой кислотой гранулоцитарной дифференцировки
Секция 5. Метаболомика и липидомика
Газовая хроматография и масс-спектрометрия, жидкостная хроматография с масс-спектрометрией, ЯМР-спектроскопия, непосредственная масс-спектрометрия (shotgun lipidomics)
Модераторы: Черноносов А. А. (ИХБФМ), Апполонова С. А. (Сеченовский университет)
Лабутин А. В. (Томск)
ОГБУЗ «Томский Областной наркологический диспансер»
Рогачёв А. Д. (Новосибирск)
Новосибирский институт органической химии им. Н. Н. Ворожцова
Черноносов А. А. (Новосибирск)
ИХБФМ
Яншоле В. В. (Новосибирск)
Международный томографический центр СО РАН
Секция 6. Омики единичных клеток
scDNA-seq, scMethyl-seq, scATAC-seq, scChIP-seq, 3′, 5′ и полнотранскриптное секвенирование
Модераторы: Денисов Е. В. (Томский НИМЦ), Волчков П. Ю. (МФТИ)
Хозяинова А. А. (Томск)
м.н.с.
НИИ онкологии Томского НИМЦ
Технологии анализа единичных клеток и пространственная транскриптомика в исследовании опухолевой пластичности
Максимов Д. О. (Долгопрудный)
м.н.с.
Центр живых систем МФТИ
Видоспецифичные адренокортикальные клеточные популяции и механизмы обновления надпочечников
Яневски А. (Санкт-Петербург)
доктор философии по медицине; Dr.philos. in Medicine; ассоциированный профессор по вычислительной биомедицине при поддержке АО «Полиметалл»
Европейский университет в Санкт-Петербурге
Одноклеточное РНК- и ДНК-секвенирование для оценки клональной гетерогенности и эволюции опухолей
Тычинин Д. И. (Москва)
аналитик отдела эпигенетических методов исследований ЦСП ФМБА России, с.н.с. научного центра «LIFT»
ЦСП ФМБА России; ЛИФТ Центр
Транскрипционные и эпигенетические изменения иммунных клеток крови при сахарном диабете 1 типа
Лукьянов Д. К. (Москва)
научный сотрудник
ГНЦ ИБХ РАН
Учёт сплайсинга в scRNA-seq раскрывает транскрипционную гетерогенность субпопуляций CD4 T-клеток
Секция 7. Пространственные омики
Транскриптомика и протеомика: имиджинг in situ и пространственное баркодирование
Модераторы: Ямщиков П. С. (Томский НИМЦ), Гусев О. А. (Центр мозга и нейротехнологий ФМБА)
Валяева А. А. (Москва)
м.н.с.
МГУ
Пространственный ландшафт стромы колоректального рака: интеграция scRNA-seq и Visium HD
Крупинова Ю. А. (Москва / Долгопрудный)
МФТИ, МКНЦ им. А. С. Логинова
Новый взгляд на происхождение нейроэндокринных опухолей поджелудочной железы
Санковски Р. И. (Freiburg)
д.м.н.
University of Freiburg
Decoding the Leptomeninges in Glioblastoma: Balancing Immune Surveillance and Tumor Progression
Иконников А. В. (Москва)
РУДН
Пространственная транскриптомика панникулитоподобной Т-клеточной лимфомы детского возраста
Коробейникова А. В. (Москва)
ЦСП ФМБА
Пространственная транскриптомная гетерогенность перстневидноклеточного рака желудка
Секция 8. Метагеномика
16S рРНК и полногеномное секвенирование, метатранскриптомика, микробиом, виром, мобилом и фунгиом
Модераторы: Шаршов К. А. (ФИЦ ФТМ), Комиссаров А. Б. (НИИ гриппа им. А. А. Смородинцева)
Гончаров А. Е. (Санкт-Петербург)
д.м.н., заведующий лабораторией микробиологического мониторинга биологических угроз
Институт экспериментальной медицины
Микробиомы ископаемых животных Арктической зоны России
Соавторы: Хорошилов В. Ю., Колоджиева В. В.
Мацвай А. Д. (Москва)
к.б.н., заведующая лабораторией молекулярной эпидемиологии
ЦСП ФМБА
Изучение разнообразия вирусов в природных резервуарах: метавиром рукокрылых
Шаршов К. А. (Новосибирск)
к.б.н., заведующий лабораторией молекулярной эпидемиологии и биоразнообразия вирусов
Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины; Новосибирский государственный университет
Вирусная метагеномика и поиск новых вирусов в клещах
Секция 9. Биоинформатика и искусственный интеллект в мультиомиксной интеграции
Модераторы: Арбатский М. С. (РНИМУ Пирогова), Оконечников К. В. (НМИЦ онкологии им. Н. Н. Блохина)
Vlamos P. (Керкира)
Ionian University
Quantitative analysis and mathematical modeling of biomarkers to support clinical decision-making and translational research
Wang Y. (Шэньчжэнь)
BGI Genomics
тема доклада уточняется
Tian C. (Пекин)
Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences
Разработка китайско-российской технологии извлечения знаний в области старения и построение базы знаний
Николаев (Москва), Кононихин А. С. (Москва)
Сколтех
База данных белков крови для мониторинга здоровья методами таргетной хромато-масс-спектрометрии
Аветисян (Москва)
ИСП РАН
тема доклада уточняется
Колпаков (Сириус)
Сириус
BioUML – towards a universal research platform
Зарубин (Томск)
Томский НИМЦ
тема доклада уточняется
Секция 10. Палеогеномика
Модераторы: Прохорчук Е. Б. (ФИЦ Биотехнологии), Недолужко А. В. (ЕУСПБ)
Малеев Л. (Москва)
Сколтех
Эпигенетические часы для древней ДНК
Жур К. (Москва)
ФИЦ Биотехнологии
Геномика строителей мегалитов Кавказа
Манахов А. (Сириус)
Сириус
Фанагория
Андреева Т. (Москва)
ИОГен
Русские
Pinhassi R. (Вена)
University of Vienna
тема доклада уточняется
Недолужко А. В. (Санкт-Петербург)
ЕУСПБ
тема доклада уточняется
